여러 가지 원인이 성욕 장애와 관련되어 있다. 성욕구 문제를 가지고 있는 환자들은 종종 자신의 성욕구를 방어적으로 억제하는데, 이는 섹스에 대한 무의식적인 공포가 있기 때문이다. 정신분석의 창시자인 지그문트 프로이트는 낮은 성욕을, 정신성적 발달단계 중 남근기(phallic psychosexual phase) 동안의 억제 및 해결되지 않은 오이디푸스 갈등(unresolved oedipal conflicts) 때문이라고 생각했다.
프로이트는 남근기에 고착된 일부 남성이 여성의 질을 두려워하며, 질에 가까이 다가가면 거세될 것이라고 믿는다고 하였다. 프로이트는 이를 이빨 달린 질(vagina dentate)이라는 개념을 사용하여 설명하였는데, 즉 질이 이빨을 가지고 있을 것이라는 남성의 무의식적인 믿음 때문에 여성의 성기와 접촉을 피하는 것을 일컫는 것이다.
또한 성적 욕구의 상실은 손상된 관계의 증거(예: 가정불화)일 수도 있으며, 또한 성적인 파트너에 대한 분노의 표현일 수도 있다. 2개월 이상 성적인 관계를 가지지 않은 젊은 기혼 여성을 대상으로 한 연구에 의하면, 부부간의 불화는 성적인 활동의 저하나 중단과 가장 흔하게 관련된 원인인 것으로 밝혀졌다. 이러한 저활동성 성욕장애는 다른 성관련 장애의 증상을 덮는 경우도 있다.
또한 성욕의 저하는 단지 배우자가 매력이 없기 때문이라고 불평하는 식으로 왜곡되어 나타나는 경우도 있다. 그러나 자세하게 정신과적인 면담을 시행해 보면 이러한 저활동성 성욕장애 환자들은 성적인 활동을 시작하는 것 자체에 대해서 관심이 거의 없으며, 성적인 도발에 대해서도 잘 반응하지 않으며, 성적인 판타지가 거의 없는 등의 이상이 있음을 알아낼 수 있다. 성욕장애의 기전에 대해서 알기 위해서 먼저 성적인 욕구에 대해서 알아볼 필요가 있다. 성욕이 있기 위해서는 다음과 같은 여러 가지 요인이 필요하다.
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